DNA sequencing is the determination of the precise sequence of nucleotides in a sample of DNA.  The most popular method for doing this is called the dideoxy method or Sanger method (named after its inventor, Frederick Sanger, who was awarded the 1980 Nobel prize in chemistry [his second] for this achievment).  DNA is synthesized from four deoxynucleotide triphosphates. The top formula shows one of them: deoxythymidine triphosphate (dTTP). Each new nucleotide is added to the 3′ -OH group of the last nucleotide added. Link to discussion of DNA synthesis.  The dideoxy method gets its name from the critical role played by synthetic nucleotides that lack the -OH at the 3′ carbon atom (red arrow). A dideoxynucleotide (dideoxythymidine triphosphate — ddTTP — is the one shown here) can be added to the growing DNA strand but when it is, chain elongation stops because there is no 3′ -OH for the next nucleotide to be attached to. For this reason, the dideoxy method is also called the chain termination method. 
|